python中包引入遇到的问题

最近在用python的flask时候发现一点问题，代码组织如下

|-app
    |-__init__.py
    |-views.py
    |-operations.py
    |-xxx.py
|-run.py

按照python的约定，app作为一个包（package），引入到run.py当中

from app import app

在app/__init__.py中加入需要引入的包

from app import views,operations,xxx

按照这样的结构运行整个项目是ok的

operations.py 写了一些后台任务的逻辑，其中有一些对象是从__init__.py当中引入的

from app import app, db_session, alarm_user, logger

单独运行operations.py来调试一部分代码时候发现了问题

if __name__ == "__main__":
    #print get_password()
    #print get_replication()
    print refresh_instance()

在PyCharm当中运行正常，但在命令行环境下无法运行，会出现如下错误：

#python operations.py
Traceback (most recent call last):
  File "operations.py", line 3, in <module>
    from app import app, db_session, alarm_user, logger
ImportError: No module named app

思索之后发现了玄机，PyCharm运行是以项目的根目录作为程序运行环境的。当进入命令行之后，我们运行operations.py时的运行环境实际是在app/目录下,因此解析app包就失败了。
解决方法，扩展python运行环境，把根目录引入运行环境

#!/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
import sys
sys.path.append("../")

from app import app, db_session, alarm_user, logger