Molecule Recognition｜共建稳健可靠的分子识别工具

是否当面对文献和专利中错综复杂的分子结构式时，感到挑战重重？

是否在寻找一个能够精确快速转换 Markush 式分子图像的工具来节省宝贵时间？

Bohrium® Apps 现推出 Molecule Recognition，一键获得 pdf 或图像中所有分子结构式和 Markush 式。

现诚邀各个领域的专家加入我们，共同提升这一工具的稳定性和可靠性。阅读下文，一起探索 Molecule Recognition，让化学作图转化无障碍。

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Molecule Recognition@Apps

目前，Molecule Recognition 已在 Bohrium® Apps 开放免费使用。你可以上传一个 pdf 文件，或一组分子结构式图像，Molecule Recognition 将自动提取 pdf 中的分子图片并识别为可编辑的 SMILES 结构式，可视化交互展示识别结果。

若交互检查发现识别有误，你可以直接在附带的结构编辑器中修改确认。所有的交互修改结果都将帮助我们改进 Molecule Recognition 的识别模型。我们将每周根据改进分子个数排名为活跃用户提供 Uni-Finder 内测机会和 Bohrium 算力体验金，欢迎大家积极使用。

下面，我们简单介绍 Molecule Recognition 的使用流程：

1. 打开https://app.bohrium.dp.tech/mol-recognition/workbench/
2. 选择 “Start New Session”, 创建一个新的 Session

3. 当你创建一个新 Session 后，你可以通过复制浏览器地址栏链接与他人共享此 Session。为了更好地描述此 Session 的内容，你可以输入当前 Session 的描述，系统将自动保存，以便将来访问或共享，当然，你也可以不输入任何描述。

4. 你可以上传一个 pdf 文件，或一组分子结构式图像。上传完后，点击 “Recognize Molecules”，系统就会将 pdf 或图片识别为多个 SMILES 表达的结构式或 Markush 式。识别过程需要几秒到几分钟的时间，在识别过程中，可通过进度条查看识别进度。

5. 识别完成后，将交互展示识别结果。其中✅表示识别成功，❌表示识别失败。pdf 文件识别出的图片将按“页号_图片号”命名。

    a. 对每个已识别分子，点击将能在下方的交互结构编辑器中预览。可以点击左侧的展开按钮并排对比图片和识别出的分子。展开状态将一直保持。    

    b. 接下来你可以对比图片和识别出的分子，如有错误，你可以直接在右侧结构式编辑器中修改，点击 Confirm 后修改会保存，并为 Molecule Recognition 提供改进数据。将所有分子确认后，点击下方的 “Download All Results” 即可下载为 sdf 文件。

6. 正如前面所说，你可以将该 Session 的链接分享给其他人，他们通过打开链接可以看到和你一样的界面，你们可以共同编辑该 Session，当前版本暂不支持历史 Session 管理，如你需要访问历史 Session，可记录历史 Session 链接。
7. 如果你需要开始新 Session，只需单击页面左上角的标题即可。

欢迎大家扫码加入 Molecule Recognition App 交流群，共同探讨建设稳健可靠的分子识别工具。

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关于 Bohrium® Apps

Bohrium® Apps 是深势科技通过 MLOps 等新一代开发工具和基础设施，让算法代码可以快速上线为易用的应用，让新想法的验证效率从几个月缩短到几天。

开发者只需简单地修改算法运行入口的 Argument Parser 相关代码，便可以自动生成算法运行所需的丰富用户界面以及完整的 Job 管理运行、用户管理、数据管理、模型管理、性能评估、付费授权和结果可视化等周边全整套功能。

对于 App 用户来说，简单四个步骤提交任务，便可快速返回结果：

1. IO Options：配置输入文件
2. Job Options：设置变量
3. System Options：配置系统级参数
4. Review：所有配置参数的摘要

目前已经有很多优秀的 App 涌现在 Bohrium® Apps 社区，如分子生成，性质预测，电池颗粒识别等 AI4S 工具应用，开箱即用，帮助大家快速完成科研任务，欢迎大家在 App 主页体验使用：https://app.bohrium.dp.tech/

我们将在「NBHub App 专栏」持续为大家介绍更多 AI4S 应用，如果你也想开发自己的 App，探索更多 AI4S 的应用可能，欢迎填写表单加入 Bohrium® Apps 开发者社区：https://dptechnology.feishu.cn/share/base/form/shrcn96VSkz0xF...