1966年，佩雷尔曼出生在列宁格勒市（现称圣彼得堡市）一个普通知识分子家庭，妈妈是数学老师，爸爸是工程师（犹太人）。他还有一个妹妹，（在佩雷尔曼的辅导下）后来也成为了一名数学家，在瑞典著名的卡罗琳医学院从事生物统计学研究工作。

家庭并不富裕，但是却给了他一个聪明的头脑。