多层架构将应用程序划分为展示层、应用层和数据存储层，提供可扩展性、可维护性和安全性。在WebSphere中开发多层架构包括识别系统需求、设计架构、安装WebSphere、配置防火墙和测试系统。尽管WebSphere多层架构功能强大，但也面临复杂性、性能、可扩展性、成本和供应商锁定的挑战。