主要观点:本期内容主要介绍 HRD 检测思路及相关产品,包括 Myriad 的 MyChoice 和 Foundation One 的 gLOH 等。
关键信息:
- 检测生物学现象可从原因和结果两维度出发,针对同源重组修复缺陷可检测其原因或结果。
- Myriad 公司在肿瘤 NGS 检测历史上地位重要,1994 年申请 BRCA 相关专利引发基因专利争论,其 MyChoice 和 MyChoice Plus 产品以 LOH + TAI + LST 加和定义 HRD score 评估 HRD 状态,不同指标有独特定义且组合计算更全面。
- ARIEL2 和 ARIEL3 临床试验表明 BRCA1/2 野生型铂敏感卵巢癌高 LOH 患者对鲁卡帕利反应好,F1 被 FDA 批准用于鲁卡帕利维持治疗相关患者的补充诊断。
重要细节: - HRD 临床检测所描述的肿瘤基因组特定改变被称为“基因组瘢痕”,杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)、大片段迁移(LST)等被作为基因组瘢痕标志物。
- Myriad 团队成员解释 LOH、TAI 和 LST 同等系数简单加和效果最好的原因,LST 分数动态范围约为其他两个分数两倍,对最终分数贡献更大。
- Foundation One 的 gLOH 依赖 F1 panel 中 3500 个 SNP 计算基因组发生 LOH 的比例,ARIEL3 研究采用 FoundationOne CDx 检测 LOH 确定 HRD 状态,高 LOH 阈值为 16%,HRD 阳性定义为 BRCA 突变或 BRCA 野生型但高 LOH。
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