主要观点：Anaconda 决定对默认通道收费，这对数据科学和机器学习社区有影响，Python 生态系统有很多重写包管理器的尝试，Astral 有 ruff 和 uv 等，conda 生态系统安装方式多样难以跟上，介绍了 pixi 工具，包括在生物信息学中的应用、设置、解决的问题（如多种安装方式、环境激活自动、内置任务、环境细节存储等），还可导入 environment.yml 文件，有相关脚注说明。

关键信息：

• Anaconda 8 月 21 日起对默认通道收费。
• Python 生态系统中 pip 2011 年 4 月发布，Anaconda 2012 年 7 月发布。
• pixi 安装简单，可在服务器和本地使用。
• pixi 解决了生物信息学中的多种问题，如自动环境激活、内置任务等。
• 可通过 pixi init --import environment.yml 导入 environment.yml 文件。

重要细节：

• prefix.dev 有关于此的文章。
• pixi 安装命令：curl -fsSL https://pixi.sh/install.sh | bash，可配置默认通道等。
• 环境激活命令：pixi shell、pixi shell-hook、pixi run。
• pixi add 可更新 pixi.toml 和 pixi.lock 文件。
• 有相关链接：[https://x.com/NM_Reid/status/...]、[https://www.theregister.com/2...]、[https://www.linkedin.com/feed...]、[https://docs.astral.sh/ruff]、[https://docs.astral.sh/uv/]、[https://github.com/casey/just]、[https://github.com/conda/cond...]（联系 Jonathan Manning 了解其关于 conda lock 文件的 TED 演讲）。