我想使用 IPython 笔记本 作为一种交互分析我用 Biopython 的 GenomeDiagram
模块制作的一些基因组图表的方法。虽然有大量关于如何使用 matplotlib
在 IPython 笔记本中获取内联图形的文档,但 GenomeDiagram 使用 ReportLab 工具包,我认为 IPython 中的内联图形不支持该工具包。
然而,我在想,解决这个问题的一种方法是将绘图/基因组图写到一个文件中,然后打开内联图像,结果与如下所示相同:
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
但是,我不知道该怎么做——或者不知道是否可行。那么有人知道图像是否可以在 IPython 中打开/显示吗?
原文由 zach 发布,翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议
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