推断 Pandas DataFrame 中的值

新手上路,请多包涵

在 Pandas DataFrame 中插入 NaN 单元非常容易:

 In [98]: df
Out[98]:
            neg       neu       pos       avg
250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
500         NaN       NaN       NaN       NaN
1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
2000        NaN       NaN       NaN       NaN
3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
4000        NaN       NaN       NaN       NaN
6000        NaN       NaN       NaN       NaN
8000        NaN       NaN       NaN       NaN
10000       NaN       NaN       NaN       NaN
20000       NaN       NaN       NaN       NaN
30000       NaN       NaN       NaN       NaN
50000       NaN       NaN       NaN       NaN

[12 rows x 4 columns]

In [99]: df.interpolate(method='nearest', axis=0)
Out[99]:
            neg       neu       pos       avg
250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
500    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
2000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
4000        NaN       NaN       NaN       NaN
6000        NaN       NaN       NaN       NaN
8000        NaN       NaN       NaN       NaN
10000       NaN       NaN       NaN       NaN
20000       NaN       NaN       NaN       NaN
30000       NaN       NaN       NaN       NaN
50000       NaN       NaN       NaN       NaN

[12 rows x 4 columns]

我还希望它使用给定的方法推断插值范围之外的 NaN 值。我怎样才能最好地做到这一点?

原文由 Jimmy C 发布,翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议

阅读 406
2 个回答

推断熊猫 DataFrame s

DataFrame s 可能被推断出来,但是,在 pandas 中没有简单的方法调用并且需要另一个库(例如 scipy.optimize )。

外推

一般来说,外推需要对被外推 的数据做出某些假设。一种方法是通过对数据进行一些通用参数化方程的 曲线拟合,以找到最能描述现有数据的参数值,然后将其用于计算超出该数据范围的值。这种方法的困难和局限性问题是,选择参数化方程时必须做出一些关于 趋势 的假设。这可以通过使用不同的方程式进行反复试验来得出所需的结果,或者有时可以从数据源中推断出来。问题中提供的数据确实不够大,无法获得拟合良好的曲线;但是,这足以说明。

以下是使用三阶多项式外推 DataFrame 的示例

f ( x ) = a x 3 + b x 2 + c x + d (Eq. 1)

此通用函数 ( func() ) 曲线拟合到每一列以获得唯一的列特定参数(即 abcd )。然后,这些参数化方程用于推断所有索引的每列中的数据 NaN s。

 import pandas as pd
from cStringIO import StringIO
from scipy.optimize import curve_fit

df = pd.read_table(StringIO('''
                neg       neu       pos       avg
    0           NaN       NaN       NaN       NaN
    250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
    500         NaN       NaN       NaN       NaN
    1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
    2000        NaN       NaN       NaN       NaN
    3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
    4000        NaN       NaN       NaN       NaN
    6000        NaN       NaN       NaN       NaN
    8000        NaN       NaN       NaN       NaN
    10000       NaN       NaN       NaN       NaN
    20000       NaN       NaN       NaN       NaN
    30000       NaN       NaN       NaN       NaN
    50000       NaN       NaN       NaN       NaN'''), sep='\s+')

# Do the original interpolation
df.interpolate(method='nearest', xis=0, inplace=True)

# Display result
print ('Interpolated data:')
print (df)
print ()

# Function to curve fit to the data
def func(x, a, b, c, d):
    return a * (x ** 3) + b * (x ** 2) + c * x + d

# Initial parameter guess, just to kick off the optimization
guess = (0.5, 0.5, 0.5, 0.5)

# Create copy of data to remove NaNs for curve fitting
fit_df = df.dropna()

# Place to store function parameters for each column
col_params = {}

# Curve fit each column
for col in fit_df.columns:
    # Get x & y
    x = fit_df.index.astype(float).values
    y = fit_df[col].values
    # Curve fit column and get curve parameters
    params = curve_fit(func, x, y, guess)
    # Store optimized parameters
    col_params[col] = params[0]

# Extrapolate each column
for col in df.columns:
    # Get the index values for NaNs in the column
    x = df[pd.isnull(df[col])].index.astype(float).values
    # Extrapolate those points with the fitted function
    df[col][x] = func(x, *col_params[col])

# Display result
print ('Extrapolated data:')
print (df)
print ()

print ('Data was extrapolated with these column functions:')
for col in col_params:
    print ('f_{}(x) = {:0.3e} x^3 + {:0.3e} x^2 + {:0.4f} x + {:0.4f}'.format(col, *col_params[col]))

外推结果

Interpolated data:
            neg       neu       pos       avg
0           NaN       NaN       NaN       NaN
250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
500    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
2000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
4000        NaN       NaN       NaN       NaN
6000        NaN       NaN       NaN       NaN
8000        NaN       NaN       NaN       NaN
10000       NaN       NaN       NaN       NaN
20000       NaN       NaN       NaN       NaN
30000       NaN       NaN       NaN       NaN
50000       NaN       NaN       NaN       NaN

Extrapolated data:
               neg          neu         pos          avg
0         0.411206     0.486983    0.631233     0.509807
250       0.508475     0.527027    0.641292     0.558931
500       0.508475     0.527027    0.641292     0.558931
1000      0.650000     0.571429    0.653983     0.625137
2000      0.650000     0.571429    0.653983     0.625137
3000      0.619718     0.663158    0.665468     0.649448
4000      0.621036     0.969232    0.708464     0.766245
6000      1.197762     2.799529    0.991552     1.662954
8000      3.281869     7.191776    1.702860     4.058855
10000     7.767992    15.272849    3.041316     8.694096
20000    97.540944   150.451269   26.103320    91.365599
30000   381.559069   546.881749   94.683310   341.042883
50000  1979.646859  2686.936912  467.861511  1711.489069

Data was extrapolated with these column functions:
f_neg(x) = 1.864e-11 x^3 + -1.471e-07 x^2 + 0.0003 x + 0.4112
f_neu(x) = 2.348e-11 x^3 + -1.023e-07 x^2 + 0.0002 x + 0.4870
f_avg(x) = 1.542e-11 x^3 + -9.016e-08 x^2 + 0.0002 x + 0.5098
f_pos(x) = 4.144e-12 x^3 + -2.107e-08 x^2 + 0.0000 x + 0.6312

绘制 avg

外推数据

如果没有更大的数据集或不知道数据的来源,这个结果可能是完全错误的,但应该举例说明推断 DataFrame 的过程。可能需要使用 func() 假设的等式来获得正确的外推。此外,也没有尝试使代码高效。

更新:

如果您的索引是非数字的,例如 DatetimeIndex请参阅此答案 以了解如何推断它们。

原文由 tmthydvnprt 发布,翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议

import pandas as pd
try:
    # for Python2
    from cStringIO import StringIO
except ImportError:
    # for Python3
    from io import StringIO

df = pd.read_table(StringIO('''
                neg       neu       pos       avg
    0           NaN       NaN       NaN       NaN
    250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
    999         NaN       NaN       NaN       NaN
    1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
    2000        NaN       NaN       NaN       NaN
    3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
    4000        NaN       NaN       NaN       NaN
    6000        NaN       NaN       NaN       NaN
    8000        NaN       NaN       NaN       NaN
    10000       NaN       NaN       NaN       NaN
    20000       NaN       NaN       NaN       NaN
    30000       NaN       NaN       NaN       NaN
    50000       NaN       NaN       NaN       NaN'''), sep='\s+')

print(df.interpolate(method='nearest', axis=0).ffill().bfill())

产量

            neg       neu       pos       avg
0      0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
250    0.508475  0.527027  0.641292  0.558931
999    0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
1000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
2000   0.650000  0.571429  0.653983  0.625137
3000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
4000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
6000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
8000   0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
10000  0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
20000  0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
30000  0.619718  0.663158  0.665468  0.649448
50000  0.619718  0.663158  0.665468  0.649448

注意:我稍微更改了您的 df 以显示插值 nearest 与执行 df.fillna 有何不同。 (参见索引为 999 的行。)

我还添加了一行索引为 0 的 NaN,以表明 bfill() 可能也是必需的。

原文由 unutbu 发布,翻译遵循 CC BY-SA 3.0 许可协议

推荐问题