Android FragmentActivity 和普通Activity切换时的动画问题

Question

项目中要自定义页面切换的效果，于是自己定义了一个activity的theme

<style name="WindowAnimThem" parent="@android:style/Animation.Activity">
            <item name="android:activityOpenEnterAnimation">@anim/in_from_left</item> 
            <item name="android:activityOpenExitAnimation">@anim/out_from_right</item> 
            <item name="android:activityCloseEnterAnimation">@anim/in_from_right</item> 
            <item name="android:activityCloseExitAnimation">@anim/out_from_left</item>    
 </style>

然后将它设置在application中，让每个activity都复用这个样式

<application
        android:name=".application.MentorProgramApplication"
        android:allowBackup="true"
        android:icon="@drawable/logo"
        android:label="@string/app_name"
        android:theme="@style/AppTheme" >

所有页面都有切换的动画，除了其中一个FragmentActivity不正常，FragmentActivity和普通Activity切换时都没有动画。
然后就想在代码里来添加切换的动画效果，如下：

activity.overridePendingTransition(R.anim.in_from_left, R.anim.out_from_right);

然而因为页面很多，一个一个添加很麻烦，之后维护起来也很麻烦。不仅如此，还要重写onkeydown事件来添加返回时的动画效果。
最难忍受的一点是切换时有时会先出现android默认的页面（黑的，有个标题栏的那种），然后再出现自己的页面。
不知道有没有好的解决方法。大家帮我支支招，多谢了。