python如何实现多个文件相同位置的数值相加

Question

我有多个文件需要整合,输出所有位点的A值，B值的总和，我通过多步shell已经实现了，但是我想知道用python应该怎么实现。
我的想法是先得到所有位点的总集，然后依次遍历文件，如果文件中有该位点，就加上相应的AB值。但是文件数目多的话，遍历就很慢，想知道有没有更好的办法。

for i in `ls *.txt`;do cut -f1-2 $i > $i.out;done
cat *.out | grep -v '#' | sort -k 1,1 -k 2,2n | uniq > all.pos
for i in `ls *.txt`;do python A.py $i $i.A;done
for i in `ls *.txt`;do python B.py $i $i.B;done
paste *.A > all-A.txt
paste *.B > all-B.txt
awk '{for(i=1;i<=NF;i++)  sum+=$i; print sum; sum=0}' all-A.txt > A.count
awk '{for(i=1;i<=NF;i++)  sum+=$i; print sum; sum=0}' all-B.txt > B.count
paste A.count B.count | awk '{OFS="\t";print $1,$2,$1+$2,$2/($1+$2)}' > output

### demo1.txt
#Chr    Pos    A    B    A+B    B/(A+B)
Chr01    11    2    1    3    0.33
Chr01    83    0    2    2    1.00
Chr02    45    1    1    2    0.50
Chr02    84    2    0    2    0.00
### demo2.txt
#Chr    Pos    A    B    A+B    B/(A+B)
Chr01    11    0    1    1    1.00
Chr01    26    0    2    2    1.00
Chr02    45    1    1    2    0.50
Chr02    84    2    0    2    0.00
### demo3.txt
#Chr    Pos    A    B    A+B    B/(A+B)
Chr01    26    2    0    3    0.00
Chr01    83    0    2    2    1.00
Chr02    45    1    1    2    0.50
Chr02    84    2    0    2    0.00
### output.txt
#Chr    Pos    A    B    A+B    B/(A+B)
Chr01    11    2    2    4    0.5
Chr01    26    2    4    6    0.67
...

Answer 1

使用multiprocessing模块的pool

Answer 2

不用钻牛角尖，先cat合并多个文件为一个文件，再用pandas模块,pd['A+B']=df['A']+df['B']