关于mongodb 百万级数据 去重 查询优化的问题

Question

现有一个企业表company，里面有100万的数据，对应一个员工表user，每个企业ID company_id对应0到多条user数据，员工表中有300万条数据；具体结构如下：

db.company.find()
{
    "_id" : ObjectId("5a4356fcac671b55711ba0f3"),
    "name":"某某企业"
    "create_time":Timestamp(1510644421, 1)
}
......

db.user.find()
{
    "_id" : ObjectId("5a4356fcac671b55711ba0f4"),
    "company_id":ObjectId("5a4356fcac671b55711ba0f3"),
    "status":0,
    "username":"小刘"
},
{
    "_id" : ObjectId("5a4356fcac671b55711ba0f4"),
    "company_id":ObjectId("5a4356fcac671b55711ba0f3"),
    "status":1,
    "username":"小马"
}

要找出所有没有员工的企业，包括company表在user里没有对应数据的，以及对应status为0的数据，每页显示十条，应该如何查找效率最快？

尝试过先找出user表里status里为1的company_id去重后取出一个数组，再用company表的_id去notin这个数组，但是数据里超过百万后，查询需要7s以上。

db.user.aggregate(
    {'$match':{'status':1}},
    {'$group':{'_id':'$company_id'}}
)；

请问能够如何优化吗