项目结构整理有什么好的工具或方法推荐？

Question

平时大家项目规划的时候怎么操作的？

如题，就是想知道大家有没有什么好的方法或工具在做项目之前把思路整理成文档。
我主要是做前端的公司内部用的Angular框架，由于做的项目挺大的，经常需要各种projection。想过几次把思路整理成流程图但是太难了，一个组件内部service, model, directive等仔细的规划都放进去的话整个流程图屏幕根本画不下。所以现在的做法就是规划个大概，开始码代码，问题就是经常码到一半发现这个某个细部的方式不如另外一种方式好，然后又重构。
通常一个项目做完，规划 -》 实现功能 -》 重构 -》 重构 -》 重构~~ 重构部分需要做好几次。
我的理想状态是：有什么好的方法可以项目从框架到细部全部都能一一顺下来清晰地形成文档，这样细部的某个实现有问题整理思路的时候就能发现，然后重新规划。最终pipeline: 规划 -》重新规划-》重新规划 -》 实现功能 -》 完结撒花。