如何在 Anaconda/Spyder 中使用 Graphviz？

Question

我正在尝试使用 Spyder 的 Graphviz（通过 Anaconda 安装）。我无法理解执行此操作所需的内容以及如何加载包、设置变量等。

我对新的 Python 和 Graphviz 和 Spyder 用户的直接方法会很棒！

此外，除了创建和运行 Graphviz 之外，如何使用预先生成的 .gv 文件从 python 运行 Graphviz？

原文由 Scott G 发布，翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议

Answer 1

以下是对我有用的步骤。这些信息中的大部分都是可用的，但散布在几个不同的 StackOverflow 帖子和其他网站上。我希望这是一个很好的一站式资源。

1. 转到 Graphviz 网站 并下载并安装到您的计算机（不需要为所有用户安装）。

2. 从 Continuum 网站 下载并安装 Anaconda3.5。

3. 将 Graphviz 添加到环境变量“Path”：

   • 转到 Computer > Properties > Advanced system settings > Environment Variables 然后在系统变量框中找到“路径”。单击路径，然后单击编辑。
   • 将 ;C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin 附加到 Path 中已经存在的许多路径的末尾。请注意，Graphviz 的路径可能因您而异，因此请确保输入正确的路径。 “bin”文件夹应该有很多文件，包括 dot.exe 应用程序。
   • 要检查安装，请转到命令提示符并输入： dot -V 这应该会返回已安装的 Graphviz 版本。例如， dot - graphviz version 2.38.0 。如果这不起作用，请输入 set 并查找 Graphviz 路径。

4. 转到 Anaconda 命令提示符并输入： pip install graphviz

5. 重新启动 Spyder 或启动它（如果尚未打开）。

6. 现在在你的 Python 脚本中添加 import graphviz

7. 下面是一个示例，说明如何使用 Graphviz 教程中的 Graphviz 创建图形并进行渲染

   import graphviz

   dot = graphviz.Digraph(comment='The Round Table')

   dot.node('A', 'King Arthur')
   dot.node('B', 'Sir Bedevere the Wise')
   dot.node('L', 'Sir Lancelot the Brave')
   dot.edges(['AB', 'AL'])
   dot.edge('B', 'L', constraint='false')

   dot.render('FileName', view=True)

1. 下面是如何从预先生成的 .gv 文件创建图形的示例（至少是探索的起点）

    from graphviz import Source
   Source.from_file('file.gv')

有用的链接：

开始使用 Graphviz 和 Python

Graphviz 属性

点指南

另一个 StackOverflow 问题

使用的版本：

Anaconda 3.5（随 Spyder 一起提供）

图形可视化 2.38

原文由 Scott G 发布，翻译遵循 CC BY-SA 3.0 许可协议

Answer 2

我悬赏了另一个问题，但后来意识到有更好的方法：

• conda install graphviz 安装 GraphViz 的二进制文件，（所以你不需要访问 GraphViz 网站，它们可能会以通常的 conda 方式保持更新。）
• conda install python-graphviz 安装 GraphViz 的 Python 前端。 （这与 pip install graphviz 相同，导致了很大的混乱。）

graphviz 前端的 conda 版本 已修补以支持 conda 安装的二进制文件 graphviz 包，因此对于 graphviz 本身，这应该是你所需要的。

对于 pydot ，但是，在 Windows 中，除非将这些二进制文件包含在 PATH 中，否则这将不起作用。您可以 在脚本中临时执行此操作：

 import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'PATH_STRING'

在调用 pydot 的命令之前。

PATH_STRING 是 C:\Anaconda3\envs\ENV_NAME\Library\bin\graphviz 对于特定的 conda 环境，或者 C:\Anaconda3\Library\bin\graphviz 对于默认环境。

（我不得不为 Tensorflow 安装一个 py3.6 环境，因为它还不支持 py3.7 并且 conda install tensorflow 挂了好几个小时，试图弄清楚如何降级我系统上的每个包。（其他安装 GraphViz 的人可能出于同样的原因这样做。））

原文由 endolith 发布，翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议