在 H5PY 中打开文件时出错（找不到文件签名）

Question

我一直在使用以下代码在 python 中使用 H5PY 打开一些在 MATLAB 中生成的 HDF5 文件：

 import h5py as h5
data='dataset.mat'
f=h5.File(data, 'r')

但是我收到以下错误：

 OSError: Unable to open file (File signature not found)

我检查过我尝试打开的文件是 7.3 版 MAT 文件并且是 HDF5 格式。事实上，我以前曾使用 H5PY 成功打开过相同的文件。我已经确认这些文件存在并且可以访问，所以我不确定错误的来源。任何建议将不胜感激，提前致谢:)

原文由 Anisha Singh 发布，翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议

Answer 1

通常消息 File signature not found 表示：

1. 您的文件已损坏。

……我觉得可能性最大。你说你以前打开过文件。也许您忘记关闭可能损坏文件的文件句柄。尝试使用 HDF5 实用程序 h5debug 检查文件（如果您在操作系统上安装了 hdf5 库，则在命令行上可用，在 Linux 上使用 dpkg -s libhdf5-dev 检查）。

2.文件不是HDF5格式。

这是您的错误消息的已知原因。但是既然你说你确定是这种情况并且你之前已经打开过文件，那么我给出这个只是供其他可能在这里绊倒的人参考：

自 2015 年 12 月（从版本 7.3 开始），Matlab 文件在其 MAT 文件级别 5 容器 中使用基于 HDF5 的格式（更多 文档）。早期版本的 MAT 文件（v4（1.0 级）、v6 和 v7 到 7.2）受 scipy 库支持并可以读取：

 import scipy.io
f = scipy.io.loadmat('dataset.mat')

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否则您可以尝试其他方法，看看错误是否仍然存在：

PyTables 是 h5py 的替代品，可在 此处 找到。

 import tables
file = tables.open_file('test.mat')

安装使用

pip install tables

如果您安装了 matlab，则 Python MATLAB Engine 是读取 MAT 文件的替代方法。文档可在此处找到： MATLAB Engine API for Python 。

 import matlab.engine
mat = matlab.engine.start_matlab()
f = mat.load("dataset.mat", nargout=1)

原文由 Honeybear 发布，翻译遵循 CC BY-SA 4.0 许可协议