AI for Genomics丨空间转录组数据表征算法 SPACE,基因组学的人工智能应用

8 月 27 日
阅读 10 分钟
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在「Meet AI4S」系列直播第二期中,我们有幸邀请到了清华大学生命科学学院张强锋实验室博士后李雨哲, 他所在的张强锋实验室属于清华大学生命科学学院,同时也是清华-北大生命科学联合中心、北京结构生物学高精尖创新中心的重要组成部分。实验室的研究侧重于生命科学和人工智能算法交叉领域、RNA 结构组技术及算法开发、...
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SAM 2最新应用落地!牛津大学团队发布Medical SAM 2,刷新医学图像分割SOTA榜

8 月 26 日
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1.5k
2023 年 4 月,Meta 公司发布了 Segment Anything Model (SAM),号称能够「分割一切」,犹如一颗重磅炸弹震荡了整个计算机视觉领域,甚至被很多人看作是颠覆传统 CV 任务的研究。
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突破万字长文输出瓶颈!清华大学开源 LongWriter-6k 数据集;7 个 CCF A 类顶会即将截稿

8 月 25 日
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当前的长上下文大模型虽能处理海量文本的输入,但由于长输出示例的匮乏,使其在生成长篇内容时却力不从心。为解决这个问题,清华大学的研究团队构建了 LongWriter-6k 数据集,能够将大模型的最大输出窗口大小扩展至 10,000+ 字!
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一键下载Meta最大视频分割数据集!含50.9K真实世界视频,覆盖47个国家

8 月 25 日
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2023 年 4 月,Meta 发布 Segment Anything Model (SAM),号称能够「分割一切」,这一颠覆传统计算机视觉 (CV) 任务的创新性成果引起了业内的广泛讨论,并被快速应用于医疗图像分割等垂直领域的研究中。日前,SAM 再升级,Meta 开源了 Segment Anything Model 2 (SAM 2),成为计算机视觉领域的又一个划时代里程碑。
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入选ACL2024主会 | InstructProtein:利用知识指令对齐蛋白质语言与人类语言

8 月 22 日
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面对蛋白质结构的复杂多变,传统实验方法在解析蛋白质结构时既耗时又费力,蛋白质大语言模型 (PLMs) 应运而生——这些专业模型以氨基酸序列作为输入,能预测蛋白质功能,甚至设计全新的蛋白质。然而,PLMs 虽然在理解氨基酸序列方面表现出色,但无法理解人类语言。
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今晚7点丨清华大学博士后李雨哲详解 Cell/Nature 子刊论文,探索基因组学的 AI 应用

8 月 21 日
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我们有幸邀请到了清华大学生命科学学院张强锋实验室博士后李雨哲,他分享的主题为「探索基因组学的 AI 应用:以空间转录组数据表征算法 SPACE 为例」, 为大家介绍空间转录组学和单细胞组学研究中的 AI 方法。
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上海交大周冰心博士:锚定稀缺生物数据挑战,图神经网络重塑蛋白质理解与生成

8 月 20 日
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8 月 12 日,上海交通大学 AI for Bioengineering 暑期学校正式开幕,吸引了来自国内外 30 余所高校和 27 家企业的百余名业内人士。在为期 3 天的学习交流中,多位行业专家、企业界代表及优秀青年学者,围绕 AI 与生物工程的融合与创新发展带来了深度分享。
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倒计时2天!清华大学博士后李雨哲详解Nature/Cell子刊论文设计思路

8 月 19 日
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Meet AI4S 第二期来了! ⏰ 8 月 21 日 19:00 分享主题:探索基因组学的 AI 应用:以空间转录组数据表征算法 SPACE 为例 ‍ 分享嘉宾:清华大学张强锋实验室博士后李雨哲 观众获益:
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抗击化疗耐药性与肿瘤复发!山东大学研究团队用 AI 构筑乳腺癌干细胞的有力防线

8 月 19 日
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乳腺癌,可谓是女性恶性肿瘤中的「头号杀手」,一直是医学界攻坚克难的重点。目前,细胞毒性化疗作为乳腺癌患者最普遍的全身治疗手段,虽然在一定程度上缓解了病情,但仍旧会出现癌细胞复发或转移的情况。
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AAAI'25 今日截稿!SD 核心成员开源比 Midjourney 还强的文生图模型,现已提供一键启动

8 月 16 日
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Midjourney 真的不香了!继 Stable Diffusion 3 于 6 月开源后,Stability AI 前核心成员 Robin Rombach 带领着新团队在本月初推出了 FLUX.1 图像生成模型家族。官方声称 FLUX.1 在多个关键指标上超越了 Midjourney v6.0 和 DALL·E 3 等文生图的头部模型,还是开源的。说的这么强,你是不是也摩拳擦掌了呢?
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入选ACL 2024!实现蛋白质数据与文本信息跨模态解读,中科大王翔团队提出蛋白质-文本生成框架ProtT3

8 月 16 日
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探索蛋白质动态结构的奥秘,不仅是推动新药研发的关键一步,更是理解生命过程的重要基石。然而,蛋白质的复杂性让人们难以直接捕捉并解析其深层结构信息,如何将错综复杂的生物数据转化为直观易懂的表达形式,一直是科研领域的一大难题。
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在线教程 | 仅需 1 张图片即可生成完整绘画过程,Lvmin Zhang 新作 Paints-Undo 上线!

8 月 15 日
阅读 2 分钟
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近年来,AI 绘画发展迅猛,衍生出了超多有意思的玩法——文生图、图像修复/增强、风格变换/迁移等等,一句 prompt,一张参考图像,只需数秒即可获得生动且颇具艺术性的图片。
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材料探索新纪元!清华大学徐勇、段文晖团队发布神经网络密度泛函框架,打开物质电子结构预测的黑箱!

8 月 15 日
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密度泛函理论 (density functional theory, DFT) 作为一种用于预测和解释材料性质的关键工具,在物理、化学、材料科学等领域都发挥着不可或缺的作用。 然而,传统 DFT 通常需要耗费大量计算资源和时间,其应用范围受到显著限制。
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直播预告丨清华大学博士后李雨哲详解 Cell/Nature 子刊论文,探索基因组学的 AI 应用

8 月 15 日
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「Meet AI4S」系列直播第二期将于 8 月 21 日 19:00 开播!HyperAI超神经有幸邀请到了清华大学张强锋实验室博士后李雨哲,为大家分享空间转录组学和单细胞组学研究中的 AI 方法。
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刚刚!ACL 2024公布7篇最佳论文,华中科技大学本科生一作成果获奖

8 月 15 日
阅读 8 分钟
1.4k
8 月 11 日,享誉全球的 Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics (计算语言学协会年度会议,简称 ACL) 在泰国曼谷正式开幕。ACL 2024 为期 6 天,除主会外,还有 34 场 Workshops。
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开营啦!| 上海交通大学 AI for Bioengineering 暑期学校开营仪式圆满举行!

8 月 13 日
阅读 3 分钟
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2024年8月12日 ,“AI for Bioengineering暑期学校”在上海交通大学闵行校区理科群楼300号报告厅开幕。本次暑期学校吸引了来自国内外30余所高校(包括芝加哥大学、曼彻斯特大学、哥伦比亚大学、爱丁堡大学、南加利福尼亚大学、北京大学、清华大学、复旦大学、中国科学院大学等)和27家企业的超过100名对人工智能与生物工程...
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国产光芯片重大突破!清华团队利用神经网络,首创全前向智能光计算训练架构

8 月 13 日
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自 2012 年以来,人工智能模型训练算力需求每 3-4 个月翻一番,每年人工智能训练模型所需算力增长幅度高达 10 倍。这就带来了一个挑战:我们如何让 AI 更快、更高效?答案可能就藏在光的世界里。
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Llama 3.1中文微调数据集已上线,超大模型一键部署

8 月 12 日
阅读 4 分钟
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7 月的 AI 圈真是卷完小模型卷大模型,精彩不停!大多数同学都能体验 GPT-4o、Mistral-Nemo 这样的小模型,但 Llama-3.1-405B 和 Mistral-Large-2 这样的超大模型让很多小伙伴犯了难。
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麻省理工/ CETI 团队用机器学习技术分离出抹香鲸发音字母表!高度类似人类语言系统,信息承载能力更强!

8 月 12 日
阅读 4 分钟
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在海洋生态学研究中,生物声学是人们获取海洋生物信息的重要途径。顾名思义,生物声学主要是对动物声音的生成、传播与接收进行研究。 随着技术的发展,科研人员目前已经能够通过解码动物发声,了解其物种、性别、个体标识或健康情况。
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全球首个!清华/上海交大等联合构建面向糖尿病诊疗的视觉-大语言模型,登 Nature 子刊

8 月 7 日
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糖尿病是全球上升最快的主要慢性病,可造成失明、肾功能衰竭、截肢、脑卒中、心肌梗死等,亦与肿瘤感染等密切相关。其中,糖尿病视网膜病变 (diabetic retinopathy, DR) 是糖尿病患者最常见的进行性眼部微血管并发症,能够影响 30-40% 的糖尿病患者。
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学术分享丨清华大学博士后李雨哲详解 Cell/Nature 子刊论文,探索基因组学的 AI 应用

8 月 6 日
阅读 3 分钟
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随着空间转录组技术的不断发展与迭代,研究者能够在单细胞分辨率下获得细胞的基因表达谱,同时保留细胞在组织内的空间位置信息。如何有效地利用这些空间信息来识别空间细胞亚型并发现组织模块,成为空间转录组数据分析的核心任务。
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首次!GPT-2赋能无线通信物理层,北大团队提出基于预训练LLM的信道预测方案

8 月 5 日
阅读 5 分钟
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在无线通信中,信号经由无线信道传递通常会受到能量衰减、噪声干扰等影响,导致用户侧接收到的信号与基站发出的信号存在一定程度的变化,就如同人们出行时受到实况道路影响,到达目的地的时间会与预期存在一定程度的差异。要想预期与实际情况相符,出行时就必须了解精确的道路状态信息,而在无线通信中,为保证信号传输...
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Meta 最大视频分割数据集已上线,规模超同类 50 倍;狂揽 9K 星!快手数字人 Demo 一键启动!

8 月 2 日
阅读 4 分钟
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AI 如何赋予静态人像生命力,使其微笑、眨眼、甚至微妙的面部表情都栩栩如生?近日,快手团队开源了 LivePortrait,只需上传一张静态照片,它就能变身为表情丰富的动态肖像,在 GitHub 上已狂揽 9K stars。该教程现已在 HyperAI超神经上线,快来急速体验一下!
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教程上新 | 文生图、图生图、图像修复三合一神器, HiDiffusion 一键启动教程现已上线!

8 月 1 日
阅读 3 分钟
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扩散模型已成为高分辨率图像合成的主流方法,传统的扩散模型虽然在图像合成方面取得了显著进展,但在扩展到更高分辨率时往往面临对象重复和计算成本增加的问题。
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水平直逼高级病理学家!清华团队提出AI基础模型ROAM,实现胶质瘤精准诊断

8 月 1 日
阅读 6 分钟
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胶质瘤是一种源自脑内神经胶质细胞的肿瘤,占据所有原发性中枢神经系统肿瘤的 40%~60%,并以成年人最常见的颅内原发性肿瘤而闻名。胶质瘤的组织病理分类非常复杂,通常分为三种亚型:星形细胞瘤、少突胶质细胞瘤和室管膜瘤,每种亚型又可进一步分为若干级别。因此,准确的分类和分级对胶质瘤的预后评估和治疗方案至关...
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Meta/东京电子/FPT软件等共同贡献,Aitomatic发布首个半导体行业开源大模型,「锁死」企业技术自主权

7 月 31 日
阅读 4 分钟
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2024 年初,研究机构 Market.us 发布报告预测,全球半导体市场规模将大幅增长,预计 2024 年可达到 6,731 亿美元,到 2032 年预计将增长至 1.3 万亿美元。
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全新生物学基准数据集LAB-Bench震撼开源!覆盖8大任务,超2.4K选择题

7 月 31 日
阅读 4 分钟
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如今,将大语言模型 (LLMs) 和 LLM 增强系统用于生物学、海洋科学、材料科学等领域的研究,进而提高科研效率、成果产出,已成为很多科学家关注的重点方向。比如,浙江大学团队曾在海洋领域推出大语言模型 OceanGPT,微软曾在生物医药领域开发大语言模型 BioGPT,上海交通大学曾在地球科学领域提出大语言模型 K2。
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入选ICML!麻省理工团队基于AlphaFold实现新突破,揭示蛋白质动态多样性

7 月 29 日
阅读 5 分钟
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作为生物体的重要组成部分,蛋白质具有不同状态,基于集体运动或无序波动的不同结构组合,采用复杂的三维结构,来执行丰富的生物功能,例如,蛋白质构象变化对转运体、通道和酶的功能至关重要,而平衡组合的特性有助于控制分子相互作用的强度和选择性。
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ICML最佳论文SD3上线公共教程!DreamBench++图像自动评估新基准来了,实现人类偏好深度对齐

7 月 26 日
阅读 4 分钟
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近日,ICML 2024 最佳论文公布了!其中就包含年度图像生成的「网红模型」——Stable Diffusion 3(简称 SD3)。SD3 是由 Stability AI 开发的最新文本到图像生成模型,前段时间已经全网开源!HyperAI 超神经现已上线 ComfyUI 工作流运行 SD3 的教程, 欢迎大家在阅读论文的同时体验 SD3 的技术革新!
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入选ACL 2024!浙大推出首个海洋大语言模型OceanGPT,水下具身智能成现实

7 月 26 日
阅读 7 分钟
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大语言模型 (LLM) 在内的 AI 工具正逐渐改变科学范式,被 Nature 列为 2024 年值得关注的科学事件之一。 作为文本数据挖掘领域的核心工具,大语言模型可以从海量文本数据中提取关键的科学信息、模式和趋势, 从而加深对不同学科的理解,并为科学研究进程、决策制定和复杂问题解决提供强有力的支持与洞见。
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